Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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