Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shisal2aA2A9G7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shisal2aA2A9G7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shisal2aA2A9G7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shisal2aA2A9G7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shisal2aA2A9G7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shisal2aA2A9G7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shisal2aA2A9G7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shisal2aA2A9G7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shisal2aA2A9G7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shisal2aA2A9G7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shisal2aA2A9G7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shisal2aA2A9G7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shisal2aA2A9G7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shisal2aA2A9G7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shisal2aA2A9G7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shisal2aA2A9G7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shisal2aA2A9G7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shisal2aA2A9G7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisal2aA2A9G7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisal2aA2A9G7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisal2aA2A9G7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisal2aA2A9G7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisal2aA2A9G7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisal2aA2A9G7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisal2aA2A9G7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisal2aA2A9G7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisal2aA2A9G7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisal2aA2A9G7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shisal2aA2A9G7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shisal2aA2A9G7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shisal2aA2A9G7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shisal2aA2A9G7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisal2aA2A9G7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisal2aA2A9G7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisal2aA2A9G7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisal2aA2A9G7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisal2aA2A9G7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisal2aA2A9G7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisal2aA2A9G7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisal2aA2A9G7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisal2aA2A9G7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisal2aA2A9G7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisal2aA2A9G7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisal2aA2A9G7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisal2aA2A9G7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisal2aA2A9G7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisal2aA2A9G7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisal2aA2A9G7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisal2aA2A9G7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisal2aA2A9G7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisal2aA2A9G7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisal2aA2A9G7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisal2aA2A9G7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisal2aA2A9G7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisal2aA2A9G7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Shisal2aA2A9G7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shisal2aA2A9G7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shisal2aA2A9G7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisal2aA2A9G7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisal2aA2A9G7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisal2aA2A9G7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisal2aA2A9G7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisal2aA2A9G7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisal2aA2A9G7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisal2aA2A9G7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisal2aA2A9G7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisal2aA2A9G7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisal2aA2A9G7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisal2aA2A9G7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shisal2aA2A9G7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shisal2aA2A9G7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shisal2aA2A9G7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shisal2aA2A9G7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shisal2aA2A9G7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shisal2aA2A9G7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shisal2aA2A9G7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shisal2aA2A9G7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shisal2aA2A9G7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shisal2aA2A9G7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Shisal2aA2A9G7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shisal2aA2A9G7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shisal2aA2A9G7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shisal2aA2A9G7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shisal2aA2A9G7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shisal2aA2A9G7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shisal2aA2A9G7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shisal2aA2A9G7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shisal2aA2A9G7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shisal2aA2A9G7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shisal2aA2A9G7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shisal2aA2A9G7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shisal2aA2A9G7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shisal2aA2A9G7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shisal2aA2A9G7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shisal2aA2A9G7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shisal2aA2A9G7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Shisal2aA2A9G7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Shisal2aA2A9G7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Shisal2aA2A9G7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119 ms