Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H0

Trbv12-1, T cell receptor beta, variable 12-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trbv12-1A0A0B4J1H0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trbv12-1A0A0B4J1H0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trbv12-1A0A0B4J1H0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trbv12-1A0A0B4J1H0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trbv12-1A0A0B4J1H0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trbv12-1A0A0B4J1H0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trbv12-1A0A0B4J1H0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trbv12-1A0A0B4J1H0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trbv12-1A0A0B4J1H0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trbv12-1A0A0B4J1H0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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