Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 TSHZ2-203ENST00000603338 3803 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 GPR19-201ENST00000332427 1743 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 OR51M1-203ENST00000642046 4092 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 DUXAP8-203ENST00000437781 2398 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 NME8-201ENST00000199447 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 GSDMB-202ENST00000360317 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 CDH13-201ENST00000268613 2722 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 RGS4-203ENST00000367909 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 FCAR-204ENST00000359272 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 RGS8-202ENST00000367556 843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 TMEM213-201ENST00000397602 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AL591368.1-202ENST00000413050 548 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 LMLN-AS1-201ENST00000423460 542 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AL513303.1-201ENST00000432452 591 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AL513304.1-201ENST00000432987 359 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AL606804.1-201ENST00000435333 538 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 RPL5P27-201ENST00000437011 881 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 LINC01525-201ENST00000442182 511 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC025176.1-201ENST00000510261 365 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 ST13P6-201ENST00000522430 1102 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 RPL41P2-201ENST00000544920 409 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 PRB1-203ENST00000545626 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 CRADD-210ENST00000552033 622 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 IQCK-206ENST00000564186 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 CBLN2-203ENST00000581073 537 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC097376.1-201ENST00000602907 997 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AP003481.1-202ENST00000608214 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC004448.4-210ENST00000610229 833 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC098590.2-201ENST00000614787 281 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC073488.7-201ENST00000633785 778 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC005614.1-201ENST00000598952 3653 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 ELF5-201ENST00000257832 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AL355974.1-201ENST00000618896 1708 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 ADH7-201ENST00000209665 2289 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 MRPS27-202ENST00000457646 2628 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC011374.1-201ENST00000564471 1567 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 OR4C1P-202ENST00000641065 1569 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 LINC02324-201ENST00000531609 1442 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC096564.2-201ENST00000512428 3147 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 ASAH1-227ENST00000636455 1777 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 DDX10P2-201ENST00000417796 2614 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AL031005.1-201ENST00000416959 723 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 FTOP1-201ENST00000419363 861 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 RN7SL688P-201ENST00000471754 275 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC008040.4-201ENST00000494834 768 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC097451.1-201ENST00000507388 653 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 LINC01950-202ENST00000513273 572 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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