Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 BRS3-201ENST00000370648 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 GAPVD1-201ENST00000265956 2667 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 ESRP1-201ENST00000358397 3756 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 COPS3-203ENST00000439936 1394 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 SLC39A12-203ENST00000377374 2639 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 EHHADH-201ENST00000231887 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 OR51L1-201ENST00000321543 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 TPPP2-201ENST00000321760 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 RNA5SP238-201ENST00000365464 120 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AL591368.1-202ENST00000413050 548 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 LMLN-AS1-201ENST00000423460 542 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 OR5P4P-201ENST00000424698 917 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 FDPSP6-201ENST00000425091 512 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AL513304.1-201ENST00000432987 359 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 CASC6-201ENST00000437768 733 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 PRKAR1AP1-201ENST00000441422 1162 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AL136115.1-201ENST00000447478 517 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 CXCR6-203ENST00000457814 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC066616.1-201ENST00000486795 413 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC018639.1-201ENST00000492994 442 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC106798.1-202ENST00000506819 589 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC226119.1-201ENST00000514073 682 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 IGLVI-42-201ENST00000522485 381 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC068790.1-201ENST00000536166 355 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 RAP1B-230ENST00000543697 734 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 UBE2CP4-201ENST00000561405 535 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 RN7SL689P-201ENST00000577215 297 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 CBLN2-203ENST00000581073 537 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC090774.2-201ENST00000584708 322 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 ZNF208-202ENST00000597040 781 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC012640.3-201ENST00000607847 430 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC133041.1-201ENST00000608389 201 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 MIR7515HG-257ENST00000625915 852 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 IFNA13-202ENST00000610660 1539 ntAPPRIS P2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 PRLR-213ENST00000514088 1440 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 PRLR-219ENST00000619676 1402 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 BMPR1B-201ENST00000264568 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 OR51E2-201ENST00000396950 2781 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC023886.2-201ENST00000321285 411 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 KLRG1-202ENST00000356986 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 RNA5SP396-201ENST00000364834 120 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 IL20-203ENST00000391930 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 GEMIN2P2-201ENST00000418195 715 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 FDPSP1-201ENST00000424976 1071 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 LINC01049-201ENST00000426840 742 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 VDAC2P3-201ENST00000430995 828 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 GAPDHP16-201ENST00000448152 962 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 RBMY3AP-201ENST00000449381 1145 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 FGF12-AS3-201ENST00000452848 291 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC040975.1-201ENST00000472104 316 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC010409.2-201ENST00000505780 478 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 IGLV1-62-201ENST00000518003 441 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 IGHVII-49-1-201ENST00000521760 224 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC025524.2-202ENST00000523042 535 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms