Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 OSBPL1A-202ENST00000357041 1869 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 HYKK-205ENST00000566332 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 ZMYND11-216ENST00000602682 1687 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 S100Z-201ENST00000317593 1468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 MACROD2-203ENST00000402914 4425 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC022507.1-201ENST00000548349 1505 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 TTR-201ENST00000237014 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 VNN3-201ENST00000275223 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 S100A5-202ENST00000368718 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 OR1N2-201ENST00000373688 1103 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 TYMSP1-201ENST00000407851 869 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC023469.1-201ENST00000409243 469 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AL390195.1-202ENST00000416099 723 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AL021707.2-202ENST00000422408 1080 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 C5orf24-203ENST00000435259 851 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AL133215.1-201ENST00000447344 342 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AL133232.1-201ENST00000458293 483 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 PDPN-205ENST00000487038 607 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC008629.1-201ENST00000506486 812 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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RTL8BQ17RB0 ROPN1B-207ENST00000511082 782 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 OR10J9P-201ENST00000511932 987 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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RTL8BQ17RB0 AP000873.2-209ENST00000528083 547 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 OR7E161P-201ENST00000533722 967 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC011611.6-201ENST00000547483 255 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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RTL8BQ17RB0 OVCH1-AS1-202ENST00000550906 654 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AL117192.1-204ENST00000553485 449 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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RTL8BQ17RB0 TRIM69-204ENST00000558329 1211 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 THSD4-AS1-204ENST00000566268 468 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 C16orf62-224ENST00000567245 573 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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RTL8BQ17RB0 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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RTL8BQ17RB0 pRNA.9-201ENST00000618609 89 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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RTL8BQ17RB0 AC110079.2-202ENST00000629093 698 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC087269.2-201ENST00000641764 975 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 BRD7P6-201ENST00000431406 1860 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AL359263.1-201ENST00000441188 2796 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 TEX11-204ENST00000395889 3133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 ZCWPW2-201ENST00000383768 1716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC007938.1-201ENST00000562524 2902 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AP002001.1-202ENST00000525797 1754 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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