Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 RPL7AP56-201ENST00000476420 791 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 RPL23AP82-208ENST00000496652 1112 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AF186996.3-201ENST00000509527 964 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 RPL37-205ENST00000509877 637 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AP003721.2-201ENST00000536495 452 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC073611.1-201ENST00000550263 647 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 LINC02289-202ENST00000556781 861 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC104938.1-203ENST00000561834 546 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC092720.1-203ENST00000563921 550 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 MIR4262-201ENST00000578394 54 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 RN7SL376P-201ENST00000578594 264 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 MIR4258-201ENST00000580920 91 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 FARSA-AS1-201ENST00000592636 241 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 RN7SL840P-201ENST00000606883 284 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC006547.1-211ENST00000609191 828 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 VDAC1P8-210ENST00000610068 1251 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 C5orf56-207ENST00000621237 486 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 PCBP1-AS1-322ENST00000628147 553 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 LINC01359-205ENST00000634604 1050 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 RGS7-202ENST00000366563 2206 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 PPP6C-201ENST00000373547 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 WDR19-207ENST00000506503 2513 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 TRAF6P1-201ENST00000429404 1558 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 ZG16-201ENST00000400752 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 IL18RAP-202ENST00000409369 1890 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 TMC1-202ENST00000340019 3068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 PLS3-202ENST00000355899 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 CASP10-201ENST00000272879 2073 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 OR10W1-201ENST00000395079 1469 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 FSTL5-203ENST00000427802 2920 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 ASB8-201ENST00000317697 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 TOPORS-202ENST00000379858 3621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 PPHLN1-202ENST00000317560 1359 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 ZC3H14-203ENST00000318308 1384 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 LAX1-202ENST00000367217 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 SUPT7L-205ENST00000464789 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 HEPACAM2-202ENST00000394468 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 F13A1-201ENST00000264870 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 GPR33-201ENST00000399285 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 KIAA1324L-203ENST00000416314 3179 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 FUT10-206ENST00000518672 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 C2orf80-201ENST00000341287 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 MGST3-202ENST00000367884 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 BEND6-201ENST00000370745 579 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 MIR128-2-201ENST00000384893 84 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 TRAV12-3-201ENST00000390442 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 OR4F7P-201ENST00000402444 931 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 PSG11-203ENST00000403486 1163 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 OR4F1P-201ENST00000405102 938 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 ST13P13-201ENST00000417082 1092 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 RBMY2GP-201ENST00000418671 1034 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 OR4F2P-201ENST00000424047 938 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 ATP13A4-AS1-201ENST00000426459 795 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC079584.1-201ENST00000426716 464 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AL353052.1-201ENST00000428673 818 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AL031963.2-201ENST00000433761 398 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 RBMY2NP-201ENST00000434454 1028 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC096543.2-201ENST00000449140 859 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 FTH1P7-201ENST00000450676 552 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 PA2G4P4-201ENST00000473864 1182 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 SEC62-AS1-201ENST00000479626 346 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 RN7SL201P-201ENST00000482306 296 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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