Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 RDH11-203ENST00000553384 1926 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AC015871.3-201ENST00000618835 2261 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 TMEM59-204ENST00000371344 2473 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 EEF1A1P16-201ENST00000325349 1414 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AC090774.4-201ENST00000578888 1372 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 OSBPL1A-202ENST00000357041 1869 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 CFAP70-204ENST00000394865 1222 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AC235097.1-201ENST00000412163 681 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 VDAC1P10-201ENST00000416715 891 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AL590095.1-201ENST00000420049 436 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 GRPEL2P2-201ENST00000421856 670 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AL513303.1-201ENST00000432452 591 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AC012485.2-201ENST00000437372 982 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AL604028.2-201ENST00000437848 788 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 PSMA6P2-201ENST00000457574 686 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AC135721.2-201ENST00000464237 300 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AP000805.1-201ENST00000471604 784 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AC131233.1-201ENST00000479200 955 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 RPS4XP23-201ENST00000487801 237 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 SMIM20-202ENST00000514384 774 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 RNA5SP518-201ENST00000515957 119 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AC087672.3-201ENST00000519323 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AC011333.1-201ENST00000520587 436 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AP001646.2-201ENST00000528645 1156 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 OR7E161P-201ENST00000533722 967 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 PCED1B-AS1-207ENST00000551432 522 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 ONECUT1-202ENST00000560699 996 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AC245033.2-201ENST00000621893 421 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AC015969.1-201ENST00000366218 1416 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 C1D-202ENST00000407324 1379 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 PAPPA-AS2-201ENST00000438048 1854 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 CCDC125-201ENST00000383374 2006 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 AC023886.2-201ENST00000321285 411 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 HOPX-204ENST00000381260 1141 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 SOD1P1-201ENST00000407803 440 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 MKX-AS1-201ENST00000412244 745 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 FABP5P1-201ENST00000423401 411 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TCF23Q7RTU1 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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