Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 CWF19L1-201ENST00000354105 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 EPYC-201ENST00000261172 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 ADCY10P1-203ENST00000567255 4569 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 NCEH1-206ENST00000543711 4062 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 AL359263.1-201ENST00000441188 2796 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 PSMC2-201ENST00000292644 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 LINC02208-201ENST00000506769 2803 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 LY75-CD302-201ENST00000504764 5650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 EMX2OS-206ENST00000551288 7280 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 ODF2L-201ENST00000294678 4267 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 LRAT-206ENST00000507827 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 CDK15-201ENST00000260967 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 SNORA70.8-201ENST00000384231 136 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 SRI-202ENST00000394641 653 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 SNRPD3-202ENST00000402849 567 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 RN7SL325P-201ENST00000460434 283 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 AC079193.1-201ENST00000460497 588 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 AC112206.2-201ENST00000503106 557 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 AC017007.5-201ENST00000511590 874 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 AC109466.1-215ENST00000519750 516 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 AC100854.1-201ENST00000520351 341 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 AC091096.2-201ENST00000523284 587 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 MIR4437-201ENST00000581331 60 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 AC104984.3-201ENST00000581946 546 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 ZNF561-AS1-208ENST00000592851 782 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 AC087894.3-201ENST00000623682 349 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 VAMP3-201ENST00000054666 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 SYCP1-202ENST00000369522 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 TRIM49D1-201ENST00000420869 1651 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 TRIM49D2-202ENST00000623787 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 FPR3-201ENST00000339223 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 OSGIN2-201ENST00000297438 4209 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 TSHZ2-201ENST00000329613 3093 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 AC096745.2-201ENST00000627783 1914 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 FOPNL-206ENST00000573968 2039 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 AC053481.2-201ENST00000602493 1815 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 WDHD1-202ENST00000420358 3722 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 CD46-208ENST00000367042 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 CLUL1-201ENST00000338387 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 AC087280.2-201ENST00000637205 4822 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 ORM1-201ENST00000259396 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 MIR498-201ENST00000385134 124 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 C21orf140-201ENST00000410005 756 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 AL589990.1-201ENST00000432210 592 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 AC104389.2-201ENST00000450768 887 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 PABPC1P10-201ENST00000464731 381 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 AF186996.1-201ENST00000466578 1015 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 PRICKLE2-AS2-201ENST00000484703 496 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 RN7SL306P-201ENST00000492941 296 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 IGKV2-29-201ENST00000521304 372 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 IGKV3-34-201ENST00000521692 293 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 FOXG1-AS1-203ENST00000551395 602 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 LINC01917-201ENST00000565170 1037 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 AC012447.1-201ENST00000577914 682 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 AC087633.2-208ENST00000612877 502 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SFTPCP11686 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms