Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 ZNF101-208ENST00000592502 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC007066.2-201ENST00000561961 1993 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 RAB2B-201ENST00000397762 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 MSL3-206ENST00000380693 2377 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 CEACAM5-203ENST00000405816 2354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 TTC33-207ENST00000637375 1824 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 MBD3L1-201ENST00000305625 748 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC023469.1-201ENST00000409243 469 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AL159174.1-201ENST00000438267 811 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC009518.3-201ENST00000438972 253 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 RPS14P7-201ENST00000473701 448 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 RN7SL306P-201ENST00000492941 296 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 CARSP2-201ENST00000520688 277 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC138811.1-201ENST00000569096 361 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC104581.3-201ENST00000573621 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC010980.1-204ENST00000589724 585 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC019080.4-201ENST00000606200 564 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 EFCAB8-204ENST00000618684 435 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 ZNF182-202ENST00000396965 3586 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 FSTL5-203ENST00000427802 2920 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 TYW1B-203ENST00000620995 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 DAZ2-208ENST00000400493 3516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 KCNMB2-201ENST00000358316 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 PPFIA2-202ENST00000407050 3903 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 OR2H2-202ENST00000641840 3061 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 CDK15-201ENST00000260967 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 LINC01994-201ENST00000496220 1808 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 ZNF595-204ENST00000609518 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 SLC39A12-203ENST00000377374 2639 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 PKP4-AS1-201ENST00000342892 4067 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 SOX6-211ENST00000528429 2656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 MIR575-201ENST00000385013 94 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 TIMD4-203ENST00000407087 1145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 SNRPEP5-201ENST00000425442 278 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AL731892.1-201ENST00000437364 1192 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 RPL21P33-201ENST00000444831 484 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AL356364.1-201ENST00000458443 182 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 RN7SL325P-201ENST00000460434 283 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AL591122.1-201ENST00000487348 492 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC117473.1-201ENST00000508616 392 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 GCSHP1-201ENST00000512554 484 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 STX18-IT1-201ENST00000515487 542 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC025524.2-202ENST00000523042 535 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 OR5F2P-201ENST00000532761 941 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 NDUFA3P4-201ENST00000560814 250 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC027801.5-201ENST00000574365 416 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC110603.1-201ENST00000580645 468 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC087894.3-201ENST00000623682 349 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms