Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 ZNF90-201ENST00000418063 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 AC087392.3-202ENST00000358446 1754 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 RND3-202ENST00000375734 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 PRLR-213ENST00000514088 1440 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 CACHD1-201ENST00000290039 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 AC090643.1-201ENST00000623600 3100 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 LINC01232-204ENST00000626729 2796 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 PSORS1C1-201ENST00000259881 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 PLGLB2-201ENST00000359481 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 RNA5SP448-201ENST00000363151 111 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 RNA5SP218-201ENST00000363188 109 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 NRIR-201ENST00000366140 799 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 FAM107B-203ENST00000378462 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 SNX18P13-201ENST00000412442 529 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 AC012462.2-201ENST00000414756 391 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 LINC01049-201ENST00000426840 742 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 LINC01732-201ENST00000435023 542 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 AL731892.1-201ENST00000437364 1192 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 AC091730.1-201ENST00000440455 692 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 AC005808.1-201ENST00000444112 381 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 CXCR6-203ENST00000457814 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 AC018475.1-201ENST00000478358 465 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 AC106760.2-201ENST00000504159 619 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 HMMR-AS1-201ENST00000514724 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 IGLV1-62-201ENST00000518003 441 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 CRYAB-207ENST00000527950 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 LINC02384-207ENST00000542875 551 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 AC011611.6-201ENST00000547483 255 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 PCED1B-AS1-207ENST00000551432 522 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 AC023908.2-201ENST00000558616 318 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 AC104984.3-201ENST00000581946 546 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 AC068802.1-201ENST00000603420 732 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 AC016747.2-203ENST00000606876 289 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 AC098590.2-201ENST00000614787 281 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 LINC01232-205ENST00000630421 1002 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 AL590396.3-201ENST00000636334 300 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 SRFBP1-201ENST00000339397 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LAMB3Q13751 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 NUP210L-202ENST00000368553 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 GSDMB-202ENST00000360317 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 RGS8-202ENST00000367556 843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 SUMO2P13-201ENST00000403109 272 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 AL355862.1-201ENST00000412705 353 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 AC007384.1-202ENST00000417026 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 AC008758.2-201ENST00000420038 695 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 AC104698.1-201ENST00000435671 276 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 RN7SL58P-201ENST00000473445 294 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 AC008496.1-201ENST00000509131 295 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 RGS5-220ENST00000528689 566 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 RAP1B-230ENST00000543697 734 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 CRADD-210ENST00000552033 622 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 AL023284.3-202ENST00000571188 543 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LAMB3Q13751 AC011483.2-201ENST00000594512 536 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms