Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 TDRKH-201ENST00000368822 3093 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 AC015871.4-201ENST00000624650 2260 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 FDFT1-208ENST00000525777 1472 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 NFAT5-208ENST00000566899 4914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 ZEB2-236ENST00000636471 9583 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 DLG2-202ENST00000330014 2789 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 ZNF592-201ENST00000299927 7863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 CRNKL1-201ENST00000377327 4370 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 TET3-202ENST00000409262 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 CLDN34-201ENST00000445307 995 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 AC011591.1-201ENST00000591379 518 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 PIAS1-201ENST00000249636 8115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 TRIM6-201ENST00000278302 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 B4GALNT2-202ENST00000393354 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 AC007938.1-201ENST00000562524 2902 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 SGMS1-AS1-201ENST00000443374 12400 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 EFNA5-201ENST00000333274 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 MTND6P1-201ENST00000417434 424 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 CRYAB-207ENST00000527950 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 ZNF185-212ENST00000539731 4334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 STAMBP-203ENST00000394073 6386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 CMKLR1-202ENST00000412676 5110 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 RBM7-204ENST00000541475 6725 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 POTEH-AS1-201ENST00000422014 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 DOCK5-201ENST00000276440 10075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 TNFSF15-202ENST00000374045 6687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 TAF1-204ENST00000423759 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 SCRN3-201ENST00000272732 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 AL592430.1-202ENST00000414383 1546 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 BTBD3-214ENST00000618296 4582 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 AC090527.1-201ENST00000557965 431 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 AL157778.1-201ENST00000626665 729 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 CPEB1-209ENST00000614918 4882 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 EDA-213ENST00000616899 4643 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 SETD5-204ENST00000406341 6582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 DOCK8-209ENST00000469391 6386 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 CSMD1-218ENST00000635120 11737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 GAPVD1-201ENST00000265956 2667 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 HCG18-240ENST00000454269 2430 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 ASNSP6-201ENST00000592770 1618 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SPHKAPQ2M3C7 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SPHKAPQ2M3C7 FANCM-202ENST00000542564 6167 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SPHKAPQ2M3C7 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SPHKAPQ2M3C7 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SPHKAPQ2M3C7 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
SPHKAPQ2M3C7 SUPT6H-202ENST00000347486 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SPHKAPQ2M3C7 GSDMB-202ENST00000360317 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SPHKAPQ2M3C7 TMC5-208ENST00000564959 2434 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SPHKAPQ2M3C7 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SPHKAPQ2M3C7 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SPHKAPQ2M3C7 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SPHKAPQ2M3C7 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SPHKAPQ2M3C7 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
SPHKAPQ2M3C7 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SPHKAPQ2M3C7 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SPHKAPQ2M3C7 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
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