Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 MYL6P4-201ENST00000477911 453 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC112206.2-201ENST00000503106 557 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 OR7E163P-201ENST00000505943 894 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC097451.1-201ENST00000507388 653 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC053481.5-201ENST00000602932 397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AL023806.2-201ENST00000603042 263 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AL031777.2-201ENST00000611953 196 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 uc_338.21-201ENST00000622458 147 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC233280.20-201ENST00000637412 416 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 UTY-210ENST00000538878 6574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 ZMYM6-203ENST00000373333 1473 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 NF1P8-201ENST00000415351 1461 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC006058.1-201ENST00000568686 5067 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 NPIPB15-201ENST00000429990 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 KIF11-201ENST00000260731 4860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AL390726.6-202ENST00000635962 1365 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 HKR1-223ENST00000591471 3472 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 PIGN-231ENST00000639174 4095 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 ZNF10-202ENST00000402932 1967 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 UTY-202ENST00000331397 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 MUSK-205ENST00000374448 2754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 EPYC-201ENST00000261172 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 CCDC77-203ENST00000422000 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 P2RY14-201ENST00000309170 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 GJB7-203ENST00000525899 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 CENPN-205ENST00000439957 1699 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
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HOXD12P35452 CARD17-201ENST00000375707 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
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HOXD12P35452 ASPH-204ENST00000389204 1290 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
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HOXD12P35452 AC008868.1-201ENST00000509786 737 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
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HOXD12P35452 RN7SKP2-201ENST00000517003 319 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AC103831.1-201ENST00000522228 422 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
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HOXD12P35452 AC024257.1-201ENST00000547523 566 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AL162171.2-201ENST00000555444 905 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
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HOXD12P35452 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
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HOXD12P35452 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 FHL1-204ENST00000370683 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 ADGRL3-214ENST00000511324 5042 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 SETD5-205ENST00000407969 6463 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
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HOXD12P35452 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AC116535.1-201ENST00000499765 2335 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 FAF2-201ENST00000261942 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 TRIM2-201ENST00000338700 6735 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AC090774.4-201ENST00000578888 1372 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 SRPX2-201ENST00000373004 6679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 RIPOR2-205ENST00000510784 3381 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 MFSD8-227ENST00000641393 4069 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AL355488.1-201ENST00000449169 2611 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 ZNF334-201ENST00000347606 3890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 ADA2-203ENST00000399837 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
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