Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 FBLN5-205ENST00000556154 1875 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 RANP5-201ENST00000427731 655 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 SNX18P14-201ENST00000429308 574 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 BACE2-IT1-201ENST00000433378 382 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AL023584.1-201ENST00000437067 349 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AL021939.1-201ENST00000441868 886 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 SDHCP3-201ENST00000445371 506 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 LINC01182-201ENST00000503532 582 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC116049.2-201ENST00000508572 754 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 GAPDHP31-201ENST00000509325 1014 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 SMCO2-203ENST00000535986 1096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AP000619.1-201ENST00000540293 1000 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC012181.2-201ENST00000570210 699 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC009171.1-201ENST00000572673 266 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 ZNF174-205ENST00000575752 1068 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC018737.1-201ENST00000603900 204 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AL022324.3-201ENST00000609330 747 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 C1orf137-201ENST00000624685 386 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AL009031.1-201ENST00000632346 1026 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AL158175.1-201ENST00000634327 1127 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 MEF2C-232ENST00000629612 2851 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 C1D-202ENST00000407324 1379 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AL390726.6-202ENST00000635962 1365 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 PLSCR2-205ENST00000497985 1441 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 MEMO1-203ENST00000404530 1482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 PIP-201ENST00000291009 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 MYL1-201ENST00000341685 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 C22orf15-202ENST00000382821 646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 PTMAP8-201ENST00000397729 342 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AL355862.1-201ENST00000412705 353 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 CDKN2AIPNLP3-201ENST00000418361 309 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AP1B1P1-202ENST00000448124 191 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC006159.1-201ENST00000452009 386 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 RPS29P5-201ENST00000452777 171 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 UBE2R2-AS1-201ENST00000454429 647 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC117382.1-201ENST00000468074 730 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 RPS23-208ENST00000512493 443 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 SNORA70.23-201ENST00000517218 151 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC008677.3-201ENST00000519146 666 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 TBX5-AS1-203ENST00000531202 822 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 RN7SL376P-201ENST00000578594 264 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AL136304.1-201ENST00000607790 509 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AL731556.2-201ENST00000615610 770 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 MIR6761-201ENST00000617899 72 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 FAM20A-207ENST00000619787 2798 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 PRLR-213ENST00000514088 1440 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 SOCS5P5-201ENST00000402732 1586 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 NOX1-201ENST00000217885 1734 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms