Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 LALBA-202ENST00000549817 1243 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 TRIM69-204ENST00000558329 1211 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 RN7SL689P-201ENST00000577215 297 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 AC114488.2-207ENST00000585660 700 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 AC011468.2-202ENST00000594362 579 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 CT45A3-202ENST00000598716 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 AC097376.1-201ENST00000602907 997 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 LRMDA-216ENST00000611306 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 SMIM11B-203ENST00000622934 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 ZRANB2-AS2-220ENST00000623721 1133 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 NUSAP1-202ENST00000414849 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 NF1P8-201ENST00000415351 1461 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 NT5C3A-201ENST00000242210 1670 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 ADI1-202ENST00000382093 3870 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 AL358913.2-201ENST00000553881 1548 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 TRAPPC2-203ENST00000380579 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 ATG12-202ENST00000500945 1430 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 GRIK1-202ENST00000389124 2712 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 PSORS1C1-201ENST00000259881 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 OR5A1-201ENST00000302030 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 S100A7-202ENST00000368723 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 AC235097.1-201ENST00000412163 681 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 LINC01687-203ENST00000420255 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 AL359633.1-201ENST00000421403 310 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 HCG25-217ENST00000422366 702 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 AC134879.1-201ENST00000426062 394 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 AC073900.1-201ENST00000429766 776 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 RPL29P7-201ENST00000440227 457 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 AC005808.1-201ENST00000444112 381 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 NPPA-AS1-202ENST00000446542 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 PABPC1P10-201ENST00000464731 381 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 NSRP1-205ENST00000479218 540 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 RN7SL776P-201ENST00000493390 268 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 AC117473.1-201ENST00000508616 392 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 AC008417.1-201ENST00000510014 565 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 AC120036.3-201ENST00000517826 292 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 IGHVII-49-1-201ENST00000521760 224 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 HNRNPCP8-201ENST00000528764 888 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 ETFBKMT-204ENST00000538391 1067 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 LINC02384-207ENST00000542875 551 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 MALAT1-203ENST00000544868 480 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 AC011611.6-201ENST00000547483 255 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 OVCH1-AS1-202ENST00000550906 654 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 MED31-202ENST00000574128 619 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 AC012640.3-201ENST00000607847 430 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 AC027271.1-201ENST00000610270 610 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 AL121583.1-201ENST00000612444 682 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 AC061709.1-202ENST00000615029 527 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 AC245033.2-201ENST00000621893 421 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 LINC01440-208ENST00000627300 699 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 AL139254.2-202ENST00000641937 1156 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 OR7E161P-202ENST00000641994 1033 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 TTC33-207ENST00000637375 1824 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 AC096564.2-201ENST00000512428 3147 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 PAPPA-AS2-201ENST00000438048 1854 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 DCX-206ENST00000496551 1320 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 BCL2L14-211ENST00000586576 1927 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 INTS7-204ENST00000440600 3136 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVS71-1P61550 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.2 ms