Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC021054.1-201ENST00000537514 2338 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 THAP12P7-201ENST00000520248 2290 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 NKRF-201ENST00000304449 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 CYFIP2-209ENST00000521420 6370 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 OIP5-AS1-201ENST00000500949 8829 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 NUMB-214ENST00000555238 3588 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 SLC5A1-201ENST00000266088 5061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 LINC02431-202ENST00000505329 1788 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 ICK-201ENST00000350082 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 FCHSD2-202ENST00000409263 932 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AL512649.2-201ENST00000446206 597 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 PTMAP1-205ENST00000455552 325 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 HNF4A-AS1-202ENST00000609152 413 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 HUWE1-202ENST00000262854 14739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 KIAA1328-207ENST00000591619 5881 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 CACNB2-209ENST00000396576 4464 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 BTBD3-215ENST00000618918 4486 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 LINC02362-203ENST00000617323 2044 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 BBS9-204ENST00000396127 3914 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 OPTN-203ENST00000378748 3521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 DAZ2-208ENST00000400493 3516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 FPR3-201ENST00000339223 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 SVIL-201ENST00000355867 7586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 NTRK3-201ENST00000317501 3826 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 GABRR1-202ENST00000435811 3106 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 ZNF507-201ENST00000311921 7638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 SPTBN1-207ENST00000615901 10226 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 GK5-201ENST00000392993 9837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 SRGAP2B-204ENST00000612199 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 RBM46-201ENST00000281722 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 RNU6-1055P-201ENST00000391085 107 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AL772337.3-201ENST00000447524 452 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 RN7SL180P-201ENST00000466769 294 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 ZNF365-211ENST00000614806 877 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AC099667.1-201ENST00000624222 469 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 CDY10P-201ENST00000452415 1567 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 CPNE4-202ENST00000502818 2120 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 ZNF286B-201ENST00000285274 5145 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 IYD-201ENST00000229447 7513 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 VWDE-206ENST00000614403 4701 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 ARG1-202ENST00000356962 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 TCF4-246ENST00000570287 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 DLG2-229ENST00000531015 2892 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 NUDT4-206ENST00000549992 3607 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 NBR1-201ENST00000341165 4656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 GULP1-203ENST00000409609 1932 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 SORBS2-204ENST00000355634 4622 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 SLC9A6-214ENST00000637581 4872 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AL022100.1-202ENST00000421214 548 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 MIR181A2HG-201ENST00000429139 662 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 PGAM4P2-201ENST00000512491 721 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 RPL17-208ENST00000580261 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 LINC02209-201ENST00000521245 2651 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 FAM182A-201ENST00000376398 5070 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.9 ms