Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 AC007091.1-201ENST00000412563 566 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 AL031005.1-201ENST00000416959 723 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 AC017104.2-201ENST00000417000 321 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 OR5P4P-201ENST00000424698 917 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 TPRG1-AS2-201ENST00000425454 479 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 LINC00160-201ENST00000430635 693 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 AC093799.1-201ENST00000452411 499 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 AC018892.2-201ENST00000457656 693 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 PGBD4P1-201ENST00000473644 407 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 RPS23-208ENST00000512493 443 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 AC013546.1-201ENST00000523232 564 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 AC018523.1-201ENST00000534211 512 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 HPS5-207ENST00000537258 1275 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 AC006205.2-201ENST00000538943 373 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 AC092868.2-201ENST00000558749 497 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 AC007785.3-202ENST00000601033 518 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 AC007262.1-201ENST00000604099 321 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 AC211433.3-201ENST00000623770 375 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 AL139254.2-202ENST00000641937 1156 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 PRDX6-201ENST00000340385 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 AL049844.3-201ENST00000454207 1496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 BPIFC-203ENST00000397452 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 NUP210L-202ENST00000368553 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 CSNK1A1-204ENST00000504676 1772 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 RPL12P13-201ENST00000310055 497 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 FAM204BP-201ENST00000369171 701 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 TRBV28-201ENST00000390400 364 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 AP004243.1-202ENST00000398983 969 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 TXNDC9-202ENST00000409434 1111 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 VN1R66P-201ENST00000412929 916 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 GAPDHP55-201ENST00000423136 803 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 AL121917.1-202ENST00000424434 367 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 CBWD5-209ENST00000430059 1242 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 PRPS1P2-201ENST00000430496 937 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 SLC8A1-AS1-207ENST00000444629 935 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 NPPA-AS1-202ENST00000446542 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 RPL5P11-201ENST00000498068 893 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 AC117473.1-201ENST00000508616 392 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 AC092336.1-201ENST00000510562 415 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 AC114947.1-201ENST00000511991 432 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 AC105345.2-201ENST00000515186 664 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 GLYATL1P4-201ENST00000529326 906 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 AC132192.1-201ENST00000531111 597 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 AC006206.2-201ENST00000537192 992 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 COX6CP11-201ENST00000555293 229 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 NDUFA3P4-201ENST00000560814 250 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 ZNF473-209ENST00000601364 603 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 CU638689.4-205ENST00000623313 596 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 AC004943.1-203ENST00000624370 1074 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 AC127071.1-201ENST00000624997 712 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 CCNT1-206ENST00000640148 596 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 DEPDC1B-201ENST00000265036 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 SNRPG-201ENST00000272348 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 ALDH1A1-202ENST00000376939 822 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 MTND6P1-201ENST00000417434 424 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 AL050320.1-201ENST00000420044 446 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
IFNB1P01574 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms