Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms