Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMED7Q9Y3B3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms