Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PRG3Q9Y2Y8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRG3Q9Y2Y8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms