Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms