Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms