Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB23Q9ULC3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms