Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA9Q9UGM1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms