Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS29Q9UBQ0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS29Q9UBQ0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS29Q9UBQ0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS29Q9UBQ0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS29Q9UBQ0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS29Q9UBQ0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS29Q9UBQ0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS29Q9UBQ0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS29Q9UBQ0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS29Q9UBQ0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS29Q9UBQ0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS29Q9UBQ0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS29Q9UBQ0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS29Q9UBQ0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS29Q9UBQ0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS29Q9UBQ0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS29Q9UBQ0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS29Q9UBQ0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS29Q9UBQ0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS29Q9UBQ0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS29Q9UBQ0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS29Q9UBQ0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS29Q9UBQ0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS29Q9UBQ0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS29Q9UBQ0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VPS29Q9UBQ0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VPS29Q9UBQ0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
VPS29Q9UBQ0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
VPS29Q9UBQ0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
VPS29Q9UBQ0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VPS29Q9UBQ0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VPS29Q9UBQ0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
VPS29Q9UBQ0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VPS29Q9UBQ0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms