Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD5

ORC3, Origin recognition complex subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC3Q9UBD5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ORC3Q9UBD5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ORC3Q9UBD5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms