Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms