Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ71

RTEL1, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1Q9NZ71 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms