Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

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Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
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