Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms