Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms