Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms