Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP1Q9BWH6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP1Q9BWH6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms