Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms