Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms