Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85AQ96PX6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85AQ96PX6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms