Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms