Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SENP8Q96LD8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms