Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJD4Q96KN9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms