Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
PRAC1Q96KF2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms