Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB13Q92826 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXB13Q92826 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXB13Q92826 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXB13Q92826 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXB13Q92826 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXB13Q92826 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXB13Q92826 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXB13Q92826 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB13Q92826 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB13Q92826 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB13Q92826 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB13Q92826 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB13Q92826 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB13Q92826 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB13Q92826 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB13Q92826 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB13Q92826 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB13Q92826 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB13Q92826 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB13Q92826 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB13Q92826 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB13Q92826 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB13Q92826 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB13Q92826 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB13Q92826 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB13Q92826 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB13Q92826 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB13Q92826 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB13Q92826 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB13Q92826 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB13Q92826 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB13Q92826 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB13Q92826 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms