Protein–RNA interactions for Protein: Q8TGU4

YER175W-A, Uncharacterized protein YER175W-A, yeastyeast

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YER175W-AQ8TGU4 snR69snR69 101 nt0.65□□□□□ -2.31
YER175W-AQ8TGU4 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt0.65□□□□□ -2.31
YER175W-AQ8TGU4 COA3YJL062W-A 258 nt0.64□□□□□ -2.31
YER175W-AQ8TGU4 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt0.63□□□□□ -2.31
YER175W-AQ8TGU4 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt0.63□□□□□ -2.31
YER175W-AQ8TGU4 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt0.63□□□□□ -2.31
YER175W-AQ8TGU4 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt0.62□□□□□ -2.31
YER175W-AQ8TGU4 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.62□□□□□ -2.31
YER175W-AQ8TGU4 BEM2YER155C 6504 nt0.62□□□□□ -2.31
YER175W-AQ8TGU4 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt0.61□□□□□ -2.31
YER175W-AQ8TGU4 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt0.6□□□□□ -2.31
YER175W-AQ8TGU4 MLP1YKR095W 5628 nt0.59□□□□□ -2.31
YER175W-AQ8TGU4 PAU4YLR461W 363 nt0.58□□□□□ -2.32
YER175W-AQ8TGU4 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt0.58□□□□□ -2.32
YER175W-AQ8TGU4 SIP4YJL089W 2490 nt0.57□□□□□ -2.32
YER175W-AQ8TGU4 RDS3YPR094W 324 nt0.56□□□□□ -2.32
YER175W-AQ8TGU4 UTP10YJL109C 5310 nt0.55□□□□□ -2.32
YER175W-AQ8TGU4 FIG2YCR089W 4830 nt0.55□□□□□ -2.32
YER175W-AQ8TGU4 SCD5YOR329C 2619 nt0.55□□□□□ -2.32
YER175W-AQ8TGU4 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.55□□□□□ -2.32
YER175W-AQ8TGU4 MBB1YJL199C 327 nt0.54□□□□□ -2.32
YER175W-AQ8TGU4 IQG1YPL242C 4488 nt0.54□□□□□ -2.32
YER175W-AQ8TGU4 MEC1YBR136W 7107 nt0.53□□□□□ -2.32
YER175W-AQ8TGU4 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt0.53□□□□□ -2.32
YER175W-AQ8TGU4 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.52□□□□□ -2.33
YER175W-AQ8TGU4 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.51□□□□□ -2.33
YER175W-AQ8TGU4 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt0.51□□□□□ -2.33
YER175W-AQ8TGU4 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt0.5□□□□□ -2.33
YER175W-AQ8TGU4 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.5□□□□□ -2.33
YER175W-AQ8TGU4 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt0.5□□□□□ -2.33
YER175W-AQ8TGU4 snR45snR45 172 nt0.46□□□□□ -2.34
YER175W-AQ8TGU4 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.45□□□□□ -2.34
YER175W-AQ8TGU4 snR50snR50 90 nt0.45□□□□□ -2.34
YER175W-AQ8TGU4 snR62snR62 100 nt0.44□□□□□ -2.34
YER175W-AQ8TGU4 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt0.44□□□□□ -2.34
YER175W-AQ8TGU4 YAR064WYAR064W 300 nt0.44□□□□□ -2.34
YER175W-AQ8TGU4 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.43□□□□□ -2.34
YER175W-AQ8TGU4 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt0.42□□□□□ -2.34
YER175W-AQ8TGU4 YMR160WYMR160W 2451 nt0.42□□□□□ -2.34
YER175W-AQ8TGU4 LOS1YKL205W 3303 nt0.41□□□□□ -2.34
YER175W-AQ8TGU4 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt0.41□□□□□ -2.34
YER175W-AQ8TGU4 Q0297Q0297 156 nt0.41□□□□□ -2.34
YER175W-AQ8TGU4 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.41□□□□□ -2.34
YER175W-AQ8TGU4 snR47snR47 99 nt0.41□□□□□ -2.34
YER175W-AQ8TGU4 YML054C-AYML054C-A 159 nt0.4□□□□□ -2.35
YER175W-AQ8TGU4 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt0.39□□□□□ -2.35
YER175W-AQ8TGU4 MLP2YIL149C 5040 nt0.38□□□□□ -2.35
YER175W-AQ8TGU4 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt0.38□□□□□ -2.35
YER175W-AQ8TGU4 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt0.36□□□□□ -2.35
YER175W-AQ8TGU4 ESP1YGR098C 4893 nt0.35□□□□□ -2.35
YER175W-AQ8TGU4 SOV1YMR066W 2697 nt0.34□□□□□ -2.36
YER175W-AQ8TGU4 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt0.33□□□□□ -2.36
YER175W-AQ8TGU4 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt0.32□□□□□ -2.36
YER175W-AQ8TGU4 AI1Q0050 2505 nt0.31□□□□□ -2.36
YER175W-AQ8TGU4 THO2YNL139C 4794 nt0.3□□□□□ -2.36
YER175W-AQ8TGU4 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.28□□□□□ -2.36
YER175W-AQ8TGU4 snR38snR38 95 nt0.28□□□□□ -2.36
YER175W-AQ8TGU4 UTP20YBL004W 7482 nt0.26□□□□□ -2.37
YER175W-AQ8TGU4 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt0.24□□□□□ -2.37
YER175W-AQ8TGU4 snR67snR67 82 nt0.23□□□□□ -2.37
YER175W-AQ8TGU4 RPL41AYDL184C 78 nt0.23□□□□□ -2.37
YER175W-AQ8TGU4 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.22□□□□□ -2.37
YER175W-AQ8TGU4 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt0.21□□□□□ -2.38
YER175W-AQ8TGU4 YKL225WYKL225W 348 nt0.19□□□□□ -2.38
YER175W-AQ8TGU4 snR128snR128 126 nt0.16□□□□□ -2.38
YER175W-AQ8TGU4 SKI7YOR076C 2244 nt0.15□□□□□ -2.38
YER175W-AQ8TGU4 snR64snR64 101 nt0.12□□□□□ -2.39
YER175W-AQ8TGU4 FMP27YLR454W 7887 nt0.11□□□□□ -2.39
YER175W-AQ8TGU4 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt0.09□□□□□ -2.4
YER175W-AQ8TGU4 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt0.09□□□□□ -2.4
YER175W-AQ8TGU4 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt0.09□□□□□ -2.4
YER175W-AQ8TGU4 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt0.09□□□□□ -2.4
YER175W-AQ8TGU4 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt0.09□□□□□ -2.4
YER175W-AQ8TGU4 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt0.09□□□□□ -2.4
YER175W-AQ8TGU4 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt0.09□□□□□ -2.4
YER175W-AQ8TGU4 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt0.09□□□□□ -2.4
YER175W-AQ8TGU4 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt0.09□□□□□ -2.4
YER175W-AQ8TGU4 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt0.09□□□□□ -2.4
YER175W-AQ8TGU4 IML1YJR138W 4755 nt0.09□□□□□ -2.4
YER175W-AQ8TGU4 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt0.04□□□□□ -2.4
YER175W-AQ8TGU4 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt0.02□□□□□ -2.41
YER175W-AQ8TGU4 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt0.02□□□□□ -2.41
YER175W-AQ8TGU4 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt0.02□□□□□ -2.41
YER175W-AQ8TGU4 snR53snR53 91 nt0□□□□□ -2.41
YER175W-AQ8TGU4 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.01□□□□□ -2.41
YER175W-AQ8TGU4 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt-0.07□□□□□ -2.42
YER175W-AQ8TGU4 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt-0.07□□□□□ -2.42
YER175W-AQ8TGU4 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt-0.07□□□□□ -2.42
YER175W-AQ8TGU4 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt-0.07□□□□□ -2.42
YER175W-AQ8TGU4 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt-0.07□□□□□ -2.42
YER175W-AQ8TGU4 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt-0.07□□□□□ -2.42
YER175W-AQ8TGU4 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt-0.07□□□□□ -2.42
YER175W-AQ8TGU4 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.07□□□□□ -2.42
YER175W-AQ8TGU4 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.08□□□□□ -2.42
YER175W-AQ8TGU4 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.08□□□□□ -2.42
YER175W-AQ8TGU4 HSX1tR(CCU)J 72 nt-0.11□□□□□ -2.43
YER175W-AQ8TGU4 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt-0.12□□□□□ -2.43
YER175W-AQ8TGU4 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt-0.12□□□□□ -2.43
YER175W-AQ8TGU4 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-0.13□□□□□ -2.43
YER175W-AQ8TGU4 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt-0.14□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 43.8 ms