Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms