Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAT1

POMGNT2, Protein O-linked-mannose beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMGNT2Q8NAT1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POMGNT2Q8NAT1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POMGNT2Q8NAT1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms