Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC47Q8N1G4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms