Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ6

TXNRD3, Thioredoxin reductase 3, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD3Q86VQ6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNRD3Q86VQ6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD3Q86VQ6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD3Q86VQ6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD3Q86VQ6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD3Q86VQ6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD3Q86VQ6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD3Q86VQ6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD3Q86VQ6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD3Q86VQ6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD3Q86VQ6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD3Q86VQ6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD3Q86VQ6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD3Q86VQ6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD3Q86VQ6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD3Q86VQ6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD3Q86VQ6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD3Q86VQ6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD3Q86VQ6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD3Q86VQ6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD3Q86VQ6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD3Q86VQ6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD3Q86VQ6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD3Q86VQ6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNRD3Q86VQ6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNRD3Q86VQ6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNRD3Q86VQ6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNRD3Q86VQ6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNRD3Q86VQ6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms