Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT27Q7Z3Y8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms