Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP54Q7Z3B4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms