Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC31.2■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC31.2■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
HECW1Q76N89 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
HECW1Q76N89 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HECW1Q76N89 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
HECW1Q76N89 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
HECW1Q76N89 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
HECW1Q76N89 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HECW1Q76N89 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
HECW1Q76N89 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
HECW1Q76N89 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
HECW1Q76N89 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
HECW1Q76N89 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
HECW1Q76N89 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HECW1Q76N89 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HECW1Q76N89 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms