Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRCAPQ6ZRS2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms